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讲座信息
(5.11)基于离子淌度质谱的代谢组学研究
5月11日下午14:00江湾化学楼A7032
发布时间:2021-05-06       

学科进展系列报告

报告题目:基于离子淌度质谱的代谢组学研究

报告人:朱正江  研究员

中国科学院上海有机化学研究所/生物化学交叉中心

报告时间:2021511 (周二) 下午14:00

报告地点:江湾校区化学楼A7032

邀请人:乔亮  研究员

The metabolome includes not just known but also unknown metabolites; however, metabolite annotation remains the bottleneck in untargeted metabolomics. Ion mobility – mass spectrometry (IM-MS) has emerged as a promising technology by providing multi-dimensional characterizations of metabolites. Recently, we curated an ion mobility CCS atlas, namely AllCCS, and developed an integrated strategy for metabolite annotation using known or unknown chemical structures. The AllCCS atlas covers vast chemical structures with >5000 experimental CCS records and ~12 million calculated CCS values for >1.6 million small molecules. We demonstrated the high accuracy and wide applicability of AllCCS with medium relative errors of 0.5-2% for a broad spectrum of small molecules. AllCCS combined with in-silico MS/MS spectra facilitated multi-dimensional match and substantially improved the accuracy and coverage of both known and unknown metabolite annotation from biological samples. Together, AllCCS is a versatile resource that enables confident metabolite annotation, revealing comprehensive chemical and metabolic insights towards biological processes.

  

朱正江研究员,中国科学院上海有机化学研究所/生物化学交叉中心

现任中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心的研究员、课题组长;2006年本科毕业于南京大学,2011年博士毕业于美国马萨诸塞大学阿默斯特分校 (UMass-Amherst)2011-2013年曾在美国加州斯克利普斯研究所从事博士后研究,2013年底回国加入中科院。有超过15年从事质谱和代谢组学研究的经历,已在Nature CommunicationsNature ChemistryNature ProtocolsAnalytical Chemistry等国际学术期刊上发表65篇论文,引用超过4800次,H-index 33;获基金委优秀青年基金项目和海外高层次人才计划(青年项目)等项目支持。兼任中国生物物理协会代谢组学分会秘书长、中国质谱学会第十届理事会理事、中国细胞生物学细胞代谢分会理事、中国药理学会分析药理分会理事、Frontiers in Molecular Biosciences杂志代谢组学副主编和Genomics, Proteomics & Bioinformatics GPB)等杂志编委。

  


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